En 1927 il fonde à Tokyo le dojo kobukan où il enseigne le daitō ryū jūjutsu. Sur cette période il reçoit de nombreux défis de grands maitres d’Art martiaux. Il en reçoit les meilleurs élevés et fait des démonstrations dans tout le japon, jusqu’à la famille impériale.
Défenseur de l’harmonie de l’univers, Ueshiba n’est pas un pacifiste pour autant : il fut enseigna 10 ans pour la police politique Kempeïtaï, donnait des cours à l’École navale, à l’École d’espionnage de Nakano ou dans la famille impériale, et encadrait la milice privée de l’Ōmoto-kyō. Il écrit lui même en 1933 que « donner la mort est un acte du Budo, car […] après la mort, la vie continue »
En 1936, il quitte le dojo de daitō ryū jūjutsu d’Osaka qu’il rend à Sokeku Takeda et se concentre sur le dojo qu’il a fondé à Tokyo où il enseigne ses techniques.
En 1941, il est invité à montrer son art à l’Empereur en personne en démonstration spéciale au Saineikan dojo, dans les sous-sols du palais impérial. La même année, à sa dernière démonstration à Hibiya Kokaido, il déclare : » Ma formation technique prend fin aujourd’hui. Dorénavant je me consacrerai à servir les kami (les dieux) et à former mon esprit. «
Fin 1941 : le Japon entre dans la Seconde Guerre mondiale en attaquant, le 7 décembre 1941, la base navale américaine de Pearl Harbor à Hawaï (annoncé par un message, Niitaka Yama Noborre « Gravissez le mont Niitaka »)[25]. La plupart des uchi-deshis sont mobilisés.
En 1942, confronté à la décision politique de fusionner les arts martiaux dans l’organisation gouvernementale Dai Nippon ButokuKai et l’envie de prendre une retraite pour parfaire son art, il part à Iwama où il unit le budo et le travail de la terre. Il délègue Minoru Hirai qui dépose l’appellation d’« aïkido », pacifique et généraliste.
En 1945, le Japon capitule. L’allocution de l’Empereur provoque l’effroi de la population, la société entière s’effondre. En 1948, les Américains, re-autorisent la reprise de l’enseignement de l’aïkido (seul parmi tous les arts martiaux). Kisshomaru Ueshiba fonde l’Aïkikaï Foundation.
